O módulo secretaria permite que os coordenadores da APAE tenham acesso aos dados dos funcionários, vinculação de funcionário por departamento, opção de cadastro de voluntários, cadastro de alunos por rota, controle de merenda escolar, além de definir o ponto de espera dos alunos(a), caso a escola tenha um veículo de transporte e realização de transferências de alunos(a).